Программа бакалавриата Зайтуны основана на интегрированной учебной программе гуманитарных наук, состоящей из курсов как исламских, так и западных традиций высшего образования. Начиная с тривиума - курсов грамматики, риторики и логики - и интенсивного изучения арабского языка, студенты проходят курсы теологии, права, истории, философии, естествознания и литературы, одновременно изучая и читая классические тексты обеих традиций. . Программа разработана таким образом, что курсы, которые будут проходить позже, будут зависеть от предыдущих курсов и основываться на них. Каждый курс и требование окончания имеют важное значение для интеллектуальной траектории учебной программы в целом.